Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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