Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms