Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms