Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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