Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms