Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms