Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms