Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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