Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms