Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms