Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms