Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms