Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms