Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C11orf40Q8WZ69 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C11orf40Q8WZ69 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C11orf40Q8WZ69 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C11orf40Q8WZ69 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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C11orf40Q8WZ69 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C11orf40Q8WZ69 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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C11orf40Q8WZ69 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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C11orf40Q8WZ69 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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