Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms