Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms