Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms