Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TTC9CQ8N5M4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TTC9CQ8N5M4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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TTC9CQ8N5M4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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