Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms