Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC2Q8IXK0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms