Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms