Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms