Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUFY3Q7L099 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms