Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms