Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LLGL2Q6P1M3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms