Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms