Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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