Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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