Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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