Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IMPG1Q17R60 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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