Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms