Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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