Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NTRK3Q16288 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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