Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP4Q15650 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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