Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLR1Q15399 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms