Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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