Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT33BQ14525 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms