Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PDE7AQ13946 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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