Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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