Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms