Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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