Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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