Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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