Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK3Q13003 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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