Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC20Q12834 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms