Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms