Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms