Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms