Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms