Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2C1P98194 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms